工控系统的三层架构一般工业企业的信息系统，可以划分为管理层、制造执行层、工业控制层。在管理信层与制造执行系统层之间，主要进行身份鉴别、访问控制、检测审计、链路冗余、内容检测等安全防护;在制造执行系统层和工业控制系统层之间，主要避免管理层直接对工业控制层的访问，保证制造执行层对工业控制层的操作唯一性。
工控系统三层架构如下图所示：通过上图可以看到，我们把工业企业信息系统划分为三个层次，分别是计划管理层、制造执行层、工业控制层。管理系统是指以ERP为代表的管理信息系统(MIS)，其中包含了许多子系统，如：生产管理、物质管理、财务管理、质量管理、车间管理、能源管理、销售管理、人事管理、设备管理、技术管理、综合管理等等，管理信息系统融信息服务、决策支持于一体。制造执行系统(MES)处于工业控制系统与管理系统之间，主要负责生产管理和调度执行。通过MES，管理者可以及时掌握和了解生产工艺各流程的运行状况和工艺参数的变化，实现对工艺的过程监视与控制。工业控制系统是由各种自动化控制组件和实时数据采集、监测的过程控制组件共同构成。主要完成加工作业、检测和操控作业、作业管理等功能。2.1.2工控系统的二层防护1、管理层与MES层之间的安全防护管理层与MES层之间的安全防护主要是为了避免管理信息系统域和MES(制造执行)域之间数据交换面临的各种威胁，具体表现为：避免非授权访问和滥用(如业务操作人员越权操作其他业务系统);对操作失误、篡改数据，抵赖行为的可控制、可追溯;避免终端违规操作;及时发现非法入侵行为;过滤恶意代码(病毒蠕虫)。